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高新区企业普瑞基准研究新成果有望助力新冠病毒的治疗与防控
发布时间:2020-02-14  来源:苏州高新区管委会  发布开发区:苏州高新技术产业开发区

  近日,苏州高新区企业普瑞基准生物医药(苏州)有限公司彭鑫鑫博士带领团队在对新型冠状病毒SARS-CoV-2的研究中取得一项新成果。该成果是通过研究新型冠状病毒与人体蛋白互作组,并结合“药物靶标网络”的方法,鉴定预期能够抗新型冠状病毒的高效药物,为新药研发和药物重定位(“老药新用”)提供支持。

  新型冠状病毒感染的肺炎疫情发生后,彭鑫鑫博士带领团队,发挥公司在生物信息学和计算基因组学领域的优势,利用机器学习策略,开展新型冠状病毒SARS-CoV-2与人体蛋白互作等方面的研究。

  “目前治疗新型冠状病毒感染的主要问题之一是缺乏有效药物,而传统来说药物研发周期比较长。面对当前迅速发展的疫情,基于大数据与人工智能技术,实现药物重定位,即老药新用,可以加快该进程。”彭鑫鑫博士介绍。

  最近十几年,随着诸多高通量技术的出现,病毒基因组、人体多组学、药物数据呈现爆炸式积累。同时,人类为应对诸如SARS、MERS等冠状病毒疫情,已进行了多种药物尝试。这都为药物重定位,即“老药新用”,提供理论上的可能。

  要实现“老药新用”,关键是要理解新型冠状病毒是如何进入人体、怎么利用人体细胞分子机器为它工作,又是如何逃避人体免疫监视的。“病毒进入人体细胞后,无论是劫持人体细胞为它工作,还是逃避免疫监视,终极目标就是实现自我的大量复制。而在分子层面,这些过程均通过病毒与人体蛋白的互作实现。因此,实现治疗药物的快速鉴定,当务之急,就是先要解析病毒蛋白和人体蛋白互作组。”彭鑫鑫解释道。

  针对这些问题,连日来,彭鑫鑫博士带领团队基于冠状病毒的基因组数据和人体多组学数据,结合机器学习的方法,研究病毒蛋白和人体蛋白的互作组。同时,结合人体多组学与药物大数据,构建“药物靶标网络”。“人体大约有2万个蛋白编码基因,我们通过整合‘药物靶标网络’与‘新型冠状病毒与人体蛋白互作组’,利用复杂网络理论分析,鉴定出抗新型冠状病毒的潜在高效药物。”彭鑫鑫告诉记者,“这些数据,可以有助于药企有针对性地进行抗新型冠状病毒的药物筛选,大大缩短药物研发周期,提高成功率。”

  彭鑫鑫博士表示,这段时间,他们一直在与时间赛跑,希望通过计算生物学方面的能力和经验,助力新型冠状病毒的治疗与防控,其基于此申报的课题“基于2019-nCov病毒与人体计算互作组的药物再定位发掘”也已入选苏州市“新型冠状病毒感染应急防治”科技专项计划。

  此外,作为湖北人,在疫情发生后,彭鑫鑫博士心寄家乡,通过苏州高新区红十字会为武汉疫情捐赠1万元人民币。“我们全家现在生活在苏州,疫情控制比较得力,要感谢苏州‘第二家乡’。同时,湖北的困难,也时时让我牵挂,希望尽我所能,为家乡作点小贡献。”彭鑫鑫博士说。

  彭鑫鑫博士是普瑞基准生物医药(苏州)有限公司全职引进的生物信息与计算生物学领域高端人才。回国之前,彭博士在美国德州大学MD安德森癌症中心生物信息与计算生物学系从事博士后研究工作,2018年9月回国全职加入普瑞基准,任高级生物信息研发科学家,带领普瑞基准的转化医学团队。2019年入选江苏省双创博士、苏州市姑苏重点产业紧缺人才计划。

  普瑞基准是一家“组学数据驱动”的新型转化医学公司,由医药产业菁英和一流科学家创建。在苏州高新区管委会与枫桥街道的支持下,普瑞基准基于自身在多组学、生物信息学和数据挖掘方面的能力优势,构建高水平的多组学实验平台和多组学数据挖掘/AI平台,已和国内多家顶级医院、顶尖药企开展合作,为临床开发创新的诊疗手段,为药企的新药研发提供支撑,获得合作伙伴和客户高度评价。

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